在我国，苹果腐烂病是影响苹果生产的三大病害之首，在各大苹果产区都普遍发生，尤其多年种植的老树上更为严重。对此，西北农林科技大学植保学院教授黄丽丽率科研团队，在国家自然科学基金和陕西省自然科学基金项目的大力支持下，从2001年1月开始至今，终于在苹果树腐烂病等重大病害生物学及防治技术研究领域取得重大成果。
在对该病害的防治研究过程中发现，传统的在冬季刮除腐烂部位树皮的方法不能有效地抑制该病害的发生和扩展，并开发出了“刷树干”的方法，同时指出6-8月是防治的关键时期，为该病害的防治提供了高效且简便易行的措施。
据了解，研究团队首先从引起苹果树腐烂病的病原菌组成、基因组结构、致病关键因子以及病害的田间防治等多个方面进行研究，从苹果树腐烂病菌含有大量的次生代谢和糖代谢相关的酶以及果胶酶，揭示了果树产生腐烂症状的原因。
研究发现，苹果树腐烂病菌果胶酶、次生代谢物合成、氮转运相关蛋白和酸性外泌蛋白酶等相关基因的扩增和表达可能是该病菌适应性浸染树皮的主要决定因子。另外，次生代谢相关基因（簇）的变异，有可能导致了该病菌的寄主偏好性。其中，由苹果黑腐皮壳属真菌Valsamali引起的苹果树腐烂病，是苹果生产中的重大毁灭性病害，其研究结果为病害有效防治方法的建立提供了理论依据。
据此研究团队提出了“早预警、诱抗性、阻侵入、控残体”的苹果树腐烂病防控新策略，为苹果树建立了三道屏障；一是冬季将果园修剪枝和病残枝粉碎或集中覆盖喷药，压低菌源量；二是在幼果期对树干喷淋自主研发的噻霉酮系列药剂，阻止病菌入侵；三是喷施诱抗剂、增施有机肥等，提高树体自身免疫力。
此外，研究团队通过连续多年的防治研究与实践，形成了一套适宜于苹果病害可持续控制的方案，从2001年起，黄丽丽科研团队先后在环渤海和黄土高原苹果产区建立了103个示范基地，培训各级农技人员和果农50余万人次。近3年统计显示，苹果树腐烂病防控新技术示范推广累计1902万亩，挽回产量损失352万吨，累计节约资金16.4亿元。
